¡Solo un barco se interpone entre la tierra y la aniquilación total! El Nadesico es la máquina de combate más formidable jamás concebida, pero debido a la escasez de soldados entrenados, la tripulación es un poco ortodoxa. ¡Los pobres jovianos no tienen ninguna posibilidad contra el mayor contingente de geek e inadaptados jamás enviado a la órbita!

Basada en la novela con el mismo título escrita por Ono Fuyumi y editada por Kodansha, la historia habla de Yoko Nakajima, que pretende llegar a ser una chica modelo en su escuela y en su casa. Un día, un hombre llamado Keiki aparece de repente, y llama a Yoko "Lord". Su destino comenzará a cambiar rápidamente a partir de entonces.

En una pequeña ciudad de un mar interior de Japón, todavía perduran animales y gente que vive sus vidas de una manera sencilla. Hitotsubashi Yurie es una estudiante corriente de instituto que vive en esa pequeña ciudad, pero un día, algo sucede que la convertirá en un Dios.