La historia del juego original se desarrolla en un futuro no muy lejano. Cinco “Puntos negros” aparecieron de repente en todo el mundo como portales a mundos paralelos. Inmediatamente después, extrañas criaturas comenzaron su invasión desde estos portales. Estas criaturas son los habitantes de los cinco mundos, los mismos mundos en diferentes marcos temporales. Con el fin de garantizar que su propio marco de tiempo futuro sobreviva, cada una de las cinco invasiones se ve obligada a luchar para eliminar los otros marcos de tiempo futuros. La clave es un dispositivo con forma de tarjeta.

Tras graduarse de preparatoria, Aoba Sukuzake se une a Eagle Jump, la desarrolladora de videojuegos responsable de Fairies Story, el juego que la obsesionaba de niña. En su primer día como un miembro trabajador de la sociedad, Aoba se dirige al trabajo en un tren atestado en plena hora punta. Consigue llegar al edificio de oficinas, pero duda, preguntándose si estará bien que siga adelante. Es entonces cuando una senpai llamada Rin Toyama aparece y le abre a Aoba las puertas de las oficinas de Eagle Jump

La historia sigue a Mira, una chica que tras conocer a cierto hombre y prometerle que descubrirá nuevos asteroides, sueña con unirse al club de astronomía en el instituto. Pero resulta que en el instituto al que ingresa ya no tiene club de astronomía desde el año anterior, y ahora se ha fusionado con el club de ciencias de la Tierra.

La historia nos lleva a la vida diaria de un gerente que entrenará a 16 futuras idols.

Un joven que seguramente había muerto en un accidente, ¡renació en otro mundo cuando era un bebé! Después de eso, fue recogido por el héroe patriota "Sage" Merlin Wolford y se le dio el nombre de Shin. Fue criado como nieto por Merlín y absorbió las enseñanzas de Merlín, ganándole algunos poderes impactantes; sin embargo, cuando cumplió 15 años, su abuelo Merlín dijo: "¡Olvidé enseñarle sentido común!" ¡La vida de fantasía de otro mundo poco convencional de un niño "anormal" comienza aquí!

La protagonista, una niña de 14 años llamada Ai Ohto, escucha una voz misteriosa mientras camina por la ciudad a altas horas de la noche. Esta voz le da un huevo y le hace señas: "Si deseas cambiar el futuro, solo necesitas elegir ahora. Cree en ti misma y rompe el huevo".

La protagonista, una niña de 14 años llamada Ai Ohto, escucha una voz misteriosa mientras camina por la ciudad a altas horas de la noche. Esta voz le da un huevo y le hace señas: "Si deseas cambiar el futuro, solo necesitas elegir ahora. Cree en ti misma y rompe el huevo".

Cuando Hiyori, una chica cuyo difunto padre le enseño la alegría de la pesca, fue a pescar a solas al mar, nunca pensó que se encontraría con una alegre joven. Un encuentro que sería el comienzo de una nueva vida para ambas.

Más allá de las barreras mágicas yace un mundo repleto de bestias feroces conocidas como Demonios de Fuego, y los únicos que pueden proteger a la humanidad de ellas son los cazadores de fuego. En los tenebrosos bosques por los que vagan las bestias es donde uno de estos expertos cazadores, Koushi, rescata del ataque de una de las criaturas a Touko. Pero su encuentro no fue casual y pone en marcha un nuevo destino.

Hitori es una chica muy introvertida e incapaz de relacionarse socialmente. Sin embargo, ama la música y su sueño es formar una banda y ser famosa. Un día, mientras iba con su guitarra, se encuentra con una chica que necesita una guitarrista para tocar urgentemente en una banda. A partir de aquí, Hitori tendrá que superar sus miedos para poder alcanzar su sueño.

Hitori es una chica muy introvertida e incapaz de relacionarse socialmente. Sin embargo, ama la música y su sueño es formar una banda y ser famosa. Un día, mientras iba con su guitarra, se encuentra con una chica que necesita una guitarrista para tocar urgentemente en una banda. A partir de aquí, Hitori tendrá que superar sus miedos para poder alcanzar su sueño.

Sistina asiste a una academia mágica para perfeccionar sus habilidades en las artes mágicas, con la esperanza de resolver el misterio del enigmático Castillo Cielo. Después de la retirada de su profesor favorito, el reemplazo, Glen, resulta ser un bastardo tarde, perezoso, y aparentemente incompetente de un instructor. ¿Cómo es que Glen fue elegido personalmente por el mejor mago en la academia ?!