Los niños de todo Tokio desaparecen misteriosamente sin previo aviso. Kotaro sospecha que Gorgom están detrás de los secuestros y sigue un autobús turístico de aspecto sospechoso con niños en él, solo para perder su rastro por un acantilado. Con la ayuda de un pescador (interpretado por el propio Ishinomori ), Kohtaro viaja a una isla remota y usa sus habilidades como Kamen Rider Black para salvar a los niños y frustrar el último plan malvado de Gorgom.

Es la historia de Shin Kazamatsuri, un joven con el que experimentan, el Dr. Kazamatsuri y el Dr. Onizuka,siendo el primero su propio padre. En lugar de contribuir a una posible cura para las enfermedades como él y su padre creen sin saberlo, está siendo fusionado genéticamente con ADN de insecto. Shin comienza a soñar con una criatura asesina que ataca la ciudad y comienza a pensar que bien podria tratarsee de el mismo...

Trata sobre la época en que se extinguieron los dinosaurios, introduciéndonos en el elemento fantástico del viaje en el tiempo de los protagonistas humanos. Son tres niños del industrializado y contaminado Japón actual: un chico y una chica especialmente sensibles en el amor a toda forma de vida de nuestro planeta y el hermano menor de la chica, que se cuela en ese fantástico viaje, siendo el miembro más travieso.