Tras un trauma de su pasado que desde entonces ha sido reprimido, una joven intenta recuperar sus recuerdos con la ayuda de un psiquiatra. Durante sus sesiones de hipnosis, repite el nombre "Tomie" pero no puede recordar de dónde lo sabe. Mientras tanto, un detective de policía investiga una serie de asesinatos brutales, donde también se topa con el nombre "Tomie". ¿Cómo están conectados los dos?

Yu es un adolescente que se ha criado en el seno de una familia muy cristiana. Recién ordenado sacerdote, su padre le obliga a confesar sus pecados, que él comete buscando la aprobación paterna. Yu se dedica diligentemente a obrar mal, hasta que sus fotos a hurtadillas de bragas de chicas lo catapultan a la fama. Pero entonces conoce a Yoko y se ve envuelto en una misteriosa secta...

Japón, siglo XIX. En el templo Nishi-Honganji, la milicia Shinsengumi está seleccionando nuevos reclutas para convertirlos en guerreros samurais. El comandante Isami Kondo y el teniente Toshizo Hijikata son los encargados de supervisar el proceso de adiestramiento que exige que cada aspirante se enfrenté a Soji Okita, el mejor hombre de la milicia.