A los 17 años Kishiro hizo una historia corta llamada "Kikai", que ganó el 15.º Premio Shōgakukan y eso lo abrió al mundo editorial. En la década de los 80 publicó varias historias cortas, como "Kaiyōsei", "Hito" (en Kadokawa shoten) y "Dai-Mashīn". En 1991 Kishiro creó una de las obras del ámbito cyberpunk que lo llevó a la fama en Japón y en Europa, Alita, ángel de combate1​, bajo la editorial Shūeisha en la revista Ultra Jump. Contó con dos OVAs en 1993. En 2006 retomó la serie con la saga Battle Angel Alita: Last Order2​ y en 2014 creó otra saga más, Battle Angel Alita: Mars Chronicle.3​ En 1998 creó Aqua Knight4​ inspirado en un mundo acuático ficticio llamado Marmondo.